Temporada
Arco de Kyoto
A jornada de Kenshin para impedir que o vilão Makoto Shishio e seu grupo, as Dez Espadas, derrubem o governo Meiji. A temporada acompanha Kenshin em sua viagem a Kyoto e seu treinamento com o mestre Hiko Seijuro, além do aprimoramento de novas habilidades por parte de seus amigos, como Sanosuke. A história culmina em uma batalha final decisiva entre Kenshin e Shishio.
Episódios
1. O Retorno do Lobo
1996-10-30
2. O Inimigo Mais Poderoso
1996-11-06
3. A Vingança do Vilão
1996-11-13
4. A Despedida de Kenshin
1996-11-27
5. A Vida Sem Kenshin
1996-12-04
6. À Procura de Kenshin
1996-12-11
7. Uma Garota Valente
1997-01-08
8. A Cidade Roubada
1997-01-15
9. O Encontro de Shishio e Kenshin
1997-01-22
10. Sojiro Versus Kenshin
1997-01-29
11. O Treinamento de Sanosuke
1997-02-05
12. A Espada Mais Poderosa
1997-02-12
13. A Luta Fatal
1997-02-19
14. O Encontro com o Mestre
1997-02-26
15. A Traição de Aoshi
1997-03-05
16. Entre a Vida e a Morte
1997-03-12
17. A Gangue Mais Poderosa
1997-03-19
18. A Fuga de Shishio
1997-04-16
19. O Navio de Aço
1997-04-23
20. O Encontro da Gangue
1997-04-30
21. O Passado de Anji
1997-05-14
22. Os Olhos do Coração
1997-05-28
23. Hora de Honrar a Promessa
1997-06-04
24. O Duelo Continua
1997-06-11
25. O Ataque à Aoiya
1997-06-18
26. O Gigante Versus o Super-Homem
1997-06-25
27. O Paraíso Contra a Terra
1997-07-02
28. O Passado de Sojiro
1997-07-09
29. A Última Batalha de Sojiro
1997-07-16
30. A Batalha Final
1997-08-06
31. A Batalha Continua
1997-08-13
32. A Luta Continua
1997-08-20
33. Uma Luta Sem Vencedor
1997-09-03
34. O Destino do Grupo Juppongatana
1997-09-10
35. A Volta ao Lar
1997-09-17